12月17日上午，在由科技部、中科院和北京市政府在北京會議中心聯合召開的“2009年中關村國家自主創新示范區百家創新型企業試點工作大會”上，包括北京碧水源科技股份有限公司在內的首批56家企業被列為中關村國家自主創新示范區創新型企業。 中共中央政治局委員、北京市委書記劉淇，市委副書記、市長郭金龍，市委常委趙鳳桐，副市長茍仲文，科技部黨組書記、副部長李學勇，中科院常務副院長白春禮，副秘書長何巖等領導出席了大會并講話。科技部、中科院及北京市有關單位、園區創新型試點企業代表等共1000余人參加本次大會。出席會議的領導還為第三批試點企業和首批自主創新型企業代表授牌。北京碧水源公司總經理文劍平作為首批自主創新型企業代表從劉淇書記手中接過牌匾。
自2007年進入第一批試點企業以來，北京碧水源公司加大自主創新的力度，積極響應國家和上級各部門有關自主創新建設的方針政策、宗旨和精神，建立健全創新體制、機制，構建自主創新模式，加快科技成果產業化和產業基地建設，在自主創新的道路上邁出了一大步。此次被授予“首批中關村國家自主創新示范區創新型企業”則是對碧水源全面自主創新工作取得突出成效的高度肯定。
在今后的工作中，公司將把劉淇書記的“要培育一批世界一流的創新型企業，進一步優化發展環境；要以建設產業基地、發展產業集群為方向，支持領軍企業做強做大，在戰略性新興產業中，形成一批具有國際影響力的高技術大公司”的講話精神落實到實處，繼續走自主創新之路，通過多種模式整合產業資源，進一步加快國際化步伐，迅速做強做大，使北京碧水源公司成為全球有影響力的污水資源化高科技企業。
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